Как распределять затраты на прямые и косвенные расходы в проектной организации?

Добрый день! В организации, занимающейся проектированием в сфере строительства, учет велся следующим образом: к прямым расходам, собираемым на 20 счете относили только работы переданные на субподряд , а все остальные расходы( в том числе и зп проектировщиков и взносы)шли на 26(ну или прочие на91). Затраты на субподряд большие, сумма прямых внушительная, видимо поэтому не прилетало вопросов про косвенные. Расходы делятся по номенклатурным группам=договорам (учет в 1С), соответственно НЗП на конец периода формируется из подписанных актов с субами , но  ещё не сданных заказчику. Очень хочется, чтобы на прямые попадала и зп со взносами проектировщиков и в идеале амортизация их компов. Но всё упирается в номенклатурные группы. Договоров много, люди работают одновременно над разными все . Попыталась попросить от руководителей хоть в процентах по сотрудникам- на каких объектах были заняты в течении месяца, сказали не будут этим заниматься...Если собирать это всё на 25 счете, проблематично выбрать базу для распределения, т.к. часть договоров могла быть отдана целиком на субподряд и они итак имеют минимальную прибыль. Т.е. если база распределения- выручка, то они могут получиться глубоко убыточным((( Или лучше наоборот собрать всё на одну номенклатурную группу «проектные работы», так называемым «котловым» методом и считать НЗП в конце месяца в экселе? Поделитесь  опытом и идеями, пожалуйста.